Την 16/3/2001, η νεοκόρισσα του Ιερού Ναού, κατά τη διάρκεια καθαριότητος της εικόνας, διαπίστωσε μετά μεγάλης εκπλήξεως ότι στην εικόνα υπήρχαν κηλίδες αίματος! Αμέσως ειδοποίησε τον Εφημέριο του Ναού, ο οποίος κατέληξε στο συμπέρασμα ότι πρόκειται περί θαύματος. Εν συνέχεια, οι πιστοί της ενορίας κατέκλυσαν τον Ιερό Ναό για να προσκυνήσουν ευλαβικά και μετά δακρύων την θαυματουργό εικόνα της Υπεραγίας Θεοτόκου. Το θαυμαστό αυτό γεγονός, προκάλεσε το ενδιαφέρον των Μέσων Μαζικής Ενημερώσεως και κατά συνέπεια πλήθος πιστών και από άλλες περιοχές των Αθηνών πήγαν στην εκκλησία του Άγιου Νεκτάριου για να προσκυνήσουν την ιερή εικόνα της Θεομήτορος. Όπως είναι λοιπόν φυσικό, η τεράστια δημοσιότης που εδόθη στο σημαντικό αυτό θέμα, προκάλεσε το ενδιαφέρον των πιστών και από άλλες περιοχές της Ελλάδος. Πλήθος κόσμου λοιπόν από τη Μακεδονία, τη Θεσσαλία, την Πελοπόννησο και τα νησιά μας, επιστράτευσε κάθε μέσον για να προσέλθει στον Ιερό Ναό της Κηπουπόλεως, ο οποίος με απόφαση του εφημέριου ιερέως παρέμενε ανοικτός στους πιστούς, όλη την ημέρα και γινόντουσαν παρακλήσεις και αγρυπνίες καθημερινώς. Η τεράστια προσέλευσης των πιστών, οδήγησε τους υπεύθυνους της Εκκλησίας να ζητήσουν τη βοήθεια της Ελληνικής Αστυνομίας, ούτως ώστε να εξυπηρετηθούν οι προσερχόμενοι στον Ιερό Ναό πιστοί και να διευκολυνθεί η κατάσταση. Αρκετοί πιστοί λοιπόν, οι οποίοι αντιμετώπιζαν προβλήματα πάσης φύσεως, όπως θέματα υγείας άλλα και άλλα οικογενειακά προβλήματα, ζήτησαν προσευχόμενοι με μεγάλη ευλάβεια τη βοήθεια της Παναγίας μας. Έτσι πολλές οικογένειες ένοιωσαν μεγάλη παρηγοριά και ανακούφιση. Πολλοί εξέφρασαν την άποψη ότι η Υπεραγία Θεοτόκος μάτωσε από τον πόνο και τη λύπη της για τον καταστροφικό σεισμό της 7/9/1999, ο οποίος έπληξε την περιοχή αυτή και γενικότερα όλη την Αττική Γη. Παρ' όλες τις παρεμβάσεις ατόμων εκτός του εκκλησιαστικού περιβάλλοντος, οι οποίοι έκαναν λόγο για μη ύπαρξη του θαύματος αυτού, προσπαθώντας να σκανδαλίσουν τους πιστούς, η ουσία είναι πως η Θεοτόκος έκανε το θαύμα της για άλλη μια φορά και η βαθιά πίστη των απλών ανθρώπων δεν αλλάζει από τέτοιου είδους προσπάθειες, γιατί η θρησκεία μας είναι ζωντανή και δεν μπορεί κανείς να την πλήξει…