Το Μοναστήρι δημιουργήθηκε το 1305 προς τιμήν της Κοιμήσεως της Θεοτόκου, αλλά το 1306 μετονομάστηκε σε Μονή Των Ταξιαρχών γιατί βρέθηκε εικόνα του Αρχάγγελου Μιχαήλ με θαυματουργό τρόπο: Όταν ο μοναχός Παρθένιος από τον Μοριά της ηπειρωτικής Ελλάδας, έφτιαξε την εικόνα, την αφιέρωσε στο συγκεκριμένο μοναστήρι και την έριξε στη θάλασσα. Τα κύματα παρέσυραν την εικόνα μέχρι τα παράλια των Θυμιανών της Χίου. Οι κάτοικοι του χωριού που βρήκαν την εικόνα αποφάσισαν να χτίσουν μια εκκλησία, ώστε να την τοποθετήσουν εκεί, αλλά ο Αρχάγγελος εμφανίστηκε στα όνειρά τους και τους υπέδειξε να μεταφέρουν την εικόνα στο συγκεκριμένο μοναστήρι των Νενήτων. Οι μοναστικές κατασκευές που υπάρχουν σήμερα είναι μεταγενέστερες, γιατί οι πρωτότυπες καταστράφηκαν από τον φρικτό σεισμό του 1881. Σήμερα υπάρχουν στο μοναστήρι 8 μοναχές. Το μοναστήρι γιορτάζει στις 8 Νοεμβρίου.